先是，毛文龍駐皮島以牽敵，二年三月，袁崇煥奏設東江餉司於寧遠，令東江自覺華島轉餉，禁登萊商船入市。自是島中京餉，俱著關寧經略驗過，始解朝鮮貢道往寧遠，不許過皮島，商賈不通，島中大飢取野菜為糧。初，文龍稱麾下兵一十餘萬，朝廷為治餉，兵科給事中王夢尹、翰林編修姜曰廣，詣島閱視，稱十萬，及登萊道王廷試復裁之，定額二萬八千人。文龍大不平，上章請餉，又累奏寧遠轉餉不便，崇煥不聽。又請自往旅順議之。

六月，崇煥致書文龍曰：知島中軍飢，發餉銀十萬，至雙島約公會議滅敵。文龍語子承祿曰：昔日彼奏減糧，今又發糧，其跡可疑。承祿曰：渠為撫臣時，已有和議疏，茲復雲滅敵，必有他意，不如勿往。文龍思久之。曰：古來戰守和，得機即行，原非可執。況我與彼，總為朝廷出力，不必猜疑，遂與部將二十人、家丁百人，引兵三千至雙島，進謁崇燠，慰勞甚至。且曰：遼東海外，止藉貴鎮與本部院兩人，同心共濟方能了局。文龍曰：職在海外數年，日以東事為慮，第餉匱軍飢耳。若大人展回天之力，使諸軍安飽，指授方略，則功可成矣。

次日，崇煥犒師，每人銀一兩、米一石、布三疋，已而文龍設宴，甫坐，忽報大清兵萬餘將渡河東。崇煥遣兵馳救，止留數百人，與文龍款語而罷。三日，崇煥登島，又大犒師。謂文龍曰：今後貴鎮與本部院以旅順為界，東行貴鎮印，西行本部院印。文龍從之。復報河西有警，崇煥思久之，謂文龍曰：願借貴鎮兵一往。文龍即令疾救。

四日，崇煥命軍士攏圍。文龍不悟。從之入。麾下欲進，袁兵圍之止，從官人圍。崇煥謂眾軍士曰：念爾等海外勞苦，每人僅得糧五斗，一家分食，言之痛酸。爾等當受本部院一拜，今後勿憂無糧，只須為朝廷出力。語畢，即拜將士答謝，淚下。

崇煥遂與文龍曰：本部院節制四鎮，清嚴海禁，恐登津受腹心之患，東江糧餉由寧遠過亦便，汝何必要解銀登津自糴，且虛耗國家多少錢糧，並無實效，要東江何用。文龍曰：公言差矣，職以義旅九十人取鎮江，不費朝廷斗米寸鐵，撫集遼瀋逃民九十餘萬，羅致各島，以為犄角，以義取朝鮮糧餉，以信括商賈錙銖，種屯鼓鑄，斬將復城，六七年來，止受國家銀一百五萬兩，米九十餘萬石，猶謂無功虛冒乎？崇煥曰：與汝談三日，誰知狼子野心，一片欺誑。若殺汝，此一塊土，異日豈朝廷所有？文龍曰：督師惟恃節制，何得殺我？崇煥曰：今日非本部院意，乃是上旨。左右色變。文龍自若。乃曰：既出上旨，亦勿辨，遂西望拜曰：臣負朝廷久矣，崇煥命旗牌官張國柄，執劍殺之。

諸將伏屍慟。崇煥曰：止斬文龍一人，余悉供職如故。命殮之，因奏文龍十二罪，並自劾。上以文龍驕悖，命崇煥安心任事，且嘉諭之。時敵警寂然，師鏇，聞文龍死，皆哭。崇煥因佯祭曰：昨殺汝是朝廷法，今祭奠是本院情。遂流淚。將士俱泣。崇煥恐變，呼文龍部下曰：若等被主帥侵糧甚苦，今有十萬金犒賞，各領三兩，眾始定。崇煥分其軍為四。毛承祿，及旗鼓徐敷奏，東江將劉興祚，與陳繼盛分將之，遂回寧遠。